Jack O'Neill est un vétéran de la guerre du Golfe. Il participe à le 1ère mission stargate avec le docteur Daniel Jackson. Après s'être débarrassés du Dieu Goa'uld Râ sur la planète Abydos Daniel reste sur Abydos et O'Neill rentre sur Terre en disant que la Porte des étoiles d'Abydos avait été détruite par une bombe nucléaire et que pour protéger Daniel que ce dernier était mort. Un an plus tard, O'Neill est rappelé de sa retraite antcipée (prise à la suite de la mission, de son divorce et de la mort accidentelle de son fils avec son arme de service) afin de diriger des missions d'exploration sur d'autres planètes. Il dirige l'équipe SG-1 qui regroupe le Dr Daniel Jakson, le capitaine Samantha Carter et enfin le jaffa Teal'c qui les rejoindra au cours de la saison 1.